Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vat1Q62465 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms