Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vamp1Q62442 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vamp1Q62442 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms