Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Hoxa13Q62424 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxa13Q62424 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms