Protein–RNA interactions for Protein: Q62384

Zpr1, Zinc finger protein ZPR1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zpr1Q62384 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zpr1Q62384 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Zpr1Q62384 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zpr1Q62384 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zpr1Q62384 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zpr1Q62384 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Zpr1Q62384 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Zpr1Q62384 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zpr1Q62384 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zpr1Q62384 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zpr1Q62384 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zpr1Q62384 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zpr1Q62384 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zpr1Q62384 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zpr1Q62384 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zpr1Q62384 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zpr1Q62384 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Zpr1Q62384 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Zpr1Q62384 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Zpr1Q62384 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Zpr1Q62384 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Zpr1Q62384 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Zpr1Q62384 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zpr1Q62384 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zpr1Q62384 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Zpr1Q62384 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms