Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Supt6hQ62383 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Supt6hQ62383 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Supt6hQ62383 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Supt6hQ62383 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Supt6hQ62383 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Supt6hQ62383 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Supt6hQ62383 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Supt6hQ62383 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Supt6hQ62383 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Supt6hQ62383 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Supt6hQ62383 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Supt6hQ62383 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Supt6hQ62383 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Supt6hQ62383 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Supt6hQ62383 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Supt6hQ62383 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Supt6hQ62383 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Supt6hQ62383 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Supt6hQ62383 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Supt6hQ62383 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Supt6hQ62383 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Supt6hQ62383 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Supt6hQ62383 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Supt6hQ62383 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Supt6hQ62383 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Supt6hQ62383 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Supt6hQ62383 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Supt6hQ62383 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Supt6hQ62383 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Supt6hQ62383 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Supt6hQ62383 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Supt6hQ62383 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Supt6hQ62383 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Supt6hQ62383 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Supt6hQ62383 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Supt6hQ62383 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Supt6hQ62383 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Supt6hQ62383 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Supt6hQ62383 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Supt6hQ62383 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Supt6hQ62383 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Supt6hQ62383 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Supt6hQ62383 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Supt6hQ62383 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Supt6hQ62383 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Supt6hQ62383 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms