Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ss18Q62280 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ss18Q62280 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms