Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SypQ62277 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SypQ62277 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SypQ62277 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SypQ62277 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SypQ62277 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SypQ62277 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SypQ62277 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SypQ62277 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SypQ62277 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SypQ62277 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SypQ62277 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SypQ62277 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SypQ62277 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SypQ62277 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SypQ62277 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SypQ62277 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SypQ62277 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SypQ62277 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SypQ62277 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SypQ62277 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SypQ62277 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SypQ62277 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SypQ62277 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SypQ62277 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SypQ62277 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SypQ62277 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SypQ62277 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SypQ62277 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SypQ62277 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SypQ62277 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SypQ62277 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SypQ62277 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SypQ62277 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SypQ62277 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SypQ62277 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SypQ62277 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SypQ62277 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SypQ62277 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SypQ62277 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SypQ62277 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SypQ62277 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SypQ62277 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SypQ62277 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SypQ62277 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SypQ62277 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SypQ62277 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SypQ62277 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SypQ62277 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SypQ62277 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SypQ62277 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SypQ62277 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SypQ62277 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SypQ62277 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SypQ62277 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SypQ62277 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SypQ62277 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SypQ62277 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SypQ62277 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SypQ62277 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SypQ62277 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SypQ62277 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SypQ62277 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SypQ62277 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SypQ62277 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SypQ62277 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SypQ62277 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SypQ62277 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SypQ62277 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SypQ62277 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SypQ62277 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SypQ62277 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SypQ62277 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SypQ62277 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SypQ62277 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SypQ62277 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SypQ62277 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SypQ62277 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SypQ62277 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SypQ62277 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SypQ62277 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SypQ62277 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SypQ62277 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SypQ62277 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SypQ62277 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SypQ62277 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SypQ62277 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SypQ62277 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SypQ62277 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SypQ62277 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SypQ62277 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SypQ62277 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SypQ62277 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SypQ62277 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SypQ62277 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SypQ62277 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SypQ62277 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SypQ62277 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SypQ62277 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SypQ62277 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms