Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sema3cQ62181 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sema3cQ62181 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms