Protein–RNA interactions for Protein: Q62100

Prm3, Protamine-3, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm3Q62100 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prm3Q62100 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Gm12656-201ENSMUST00000118149 577 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
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Prm3Q62100 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 AC168059.2-201ENSMUST00000224473 333 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Gm8641-201ENSMUST00000186995 826 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 4930595O18Rik-201ENSMUST00000205099 607 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 CAAA01216754.4-203ENSMUST00000217178 1097 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Gm26563-202ENSMUST00000181152 1931 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Olfr1038-ps-201ENSMUST00000149775 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Ptma-202ENSMUST00000186255 768 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Gm19269-201ENSMUST00000211401 804 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
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Prm3Q62100 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Eif3s6-ps4-201ENSMUST00000202873 1388 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Gm7350-201ENSMUST00000120964 636 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Gm19175-201ENSMUST00000199895 916 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Nsmce2-201ENSMUST00000079703 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Gm20407-201ENSMUST00000172891 598 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 Gm36966-201ENSMUST00000192217 413 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Prm3Q62100 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms