Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Itga6Q61739 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga6Q61739 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itga6Q61739 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms