Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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AtrxQ61687 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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AtrxQ61687 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AtrxQ61687 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AtrxQ61687 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AtrxQ61687 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AtrxQ61687 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AtrxQ61687 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AtrxQ61687 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AtrxQ61687 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AtrxQ61687 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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