Protein–RNA interactions for Protein: Q61526

Erbb3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erbb3Q61526 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Erbb3Q61526 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Erbb3Q61526 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Erbb3Q61526 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Erbb3Q61526 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Erbb3Q61526 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Erbb3Q61526 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Erbb3Q61526 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Erbb3Q61526 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Erbb3Q61526 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Erbb3Q61526 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Erbb3Q61526 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Erbb3Q61526 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Erbb3Q61526 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Erbb3Q61526 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Erbb3Q61526 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Erbb3Q61526 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Erbb3Q61526 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Erbb3Q61526 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Erbb3Q61526 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms