Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcd1Q61466 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcd1Q61466 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcd1Q61466 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcd1Q61466 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcd1Q61466 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcd1Q61466 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcd1Q61466 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcd1Q61466 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcd1Q61466 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcd1Q61466 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcd1Q61466 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcd1Q61466 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcd1Q61466 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcd1Q61466 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcd1Q61466 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Smarcd1Q61466 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Smarcd1Q61466 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms