Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vsx2Q61412 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vsx2Q61412 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms