Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pde3bQ61409 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pde3bQ61409 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pde3bQ61409 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde3bQ61409 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde3bQ61409 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde3bQ61409 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde3bQ61409 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde3bQ61409 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde3bQ61409 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde3bQ61409 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde3bQ61409 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde3bQ61409 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde3bQ61409 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde3bQ61409 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde3bQ61409 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde3bQ61409 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde3bQ61409 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde3bQ61409 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde3bQ61409 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde3bQ61409 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde3bQ61409 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde3bQ61409 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde3bQ61409 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde3bQ61409 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde3bQ61409 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde3bQ61409 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde3bQ61409 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde3bQ61409 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde3bQ61409 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde3bQ61409 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde3bQ61409 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde3bQ61409 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde3bQ61409 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde3bQ61409 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde3bQ61409 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde3bQ61409 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde3bQ61409 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde3bQ61409 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde3bQ61409 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde3bQ61409 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde3bQ61409 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde3bQ61409 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde3bQ61409 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde3bQ61409 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde3bQ61409 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde3bQ61409 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Pde3bQ61409 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde3bQ61409 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde3bQ61409 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde3bQ61409 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde3bQ61409 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde3bQ61409 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde3bQ61409 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde3bQ61409 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde3bQ61409 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde3bQ61409 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde3bQ61409 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde3bQ61409 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde3bQ61409 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde3bQ61409 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde3bQ61409 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde3bQ61409 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde3bQ61409 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde3bQ61409 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde3bQ61409 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde3bQ61409 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde3bQ61409 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde3bQ61409 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde3bQ61409 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde3bQ61409 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde3bQ61409 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde3bQ61409 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde3bQ61409 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde3bQ61409 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde3bQ61409 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde3bQ61409 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde3bQ61409 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde3bQ61409 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde3bQ61409 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde3bQ61409 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde3bQ61409 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde3bQ61409 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde3bQ61409 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde3bQ61409 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde3bQ61409 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde3bQ61409 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde3bQ61409 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde3bQ61409 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde3bQ61409 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde3bQ61409 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde3bQ61409 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde3bQ61409 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde3bQ61409 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde3bQ61409 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde3bQ61409 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde3bQ61409 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde3bQ61409 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde3bQ61409 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde3bQ61409 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms