Protein–RNA interactions for Protein: Q61286

Tcf12, Transcription factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf12Q61286 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tcf12Q61286 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tcf12Q61286 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tcf12Q61286 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tcf12Q61286 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tcf12Q61286 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tcf12Q61286 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tcf12Q61286 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tcf12Q61286 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tcf12Q61286 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Tcf12Q61286 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tcf12Q61286 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tcf12Q61286 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tcf12Q61286 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tcf12Q61286 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tcf12Q61286 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tcf12Q61286 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tcf12Q61286 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tcf12Q61286 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tcf12Q61286 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tcf12Q61286 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tcf12Q61286 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tcf12Q61286 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcf12Q61286 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcf12Q61286 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcf12Q61286 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcf12Q61286 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcf12Q61286 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcf12Q61286 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcf12Q61286 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcf12Q61286 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcf12Q61286 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcf12Q61286 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcf12Q61286 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcf12Q61286 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcf12Q61286 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcf12Q61286 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcf12Q61286 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcf12Q61286 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcf12Q61286 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcf12Q61286 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcf12Q61286 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcf12Q61286 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcf12Q61286 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcf12Q61286 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tcf12Q61286 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcf12Q61286 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcf12Q61286 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcf12Q61286 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcf12Q61286 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcf12Q61286 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcf12Q61286 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcf12Q61286 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcf12Q61286 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcf12Q61286 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcf12Q61286 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tcf12Q61286 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcf12Q61286 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcf12Q61286 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcf12Q61286 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcf12Q61286 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcf12Q61286 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcf12Q61286 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcf12Q61286 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcf12Q61286 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcf12Q61286 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcf12Q61286 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcf12Q61286 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcf12Q61286 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcf12Q61286 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcf12Q61286 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcf12Q61286 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcf12Q61286 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcf12Q61286 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcf12Q61286 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Tcf12Q61286 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcf12Q61286 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcf12Q61286 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcf12Q61286 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcf12Q61286 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcf12Q61286 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcf12Q61286 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcf12Q61286 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcf12Q61286 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcf12Q61286 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcf12Q61286 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcf12Q61286 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcf12Q61286 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcf12Q61286 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcf12Q61286 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcf12Q61286 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcf12Q61286 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcf12Q61286 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcf12Q61286 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcf12Q61286 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcf12Q61286 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcf12Q61286 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcf12Q61286 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tcf12Q61286 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tcf12Q61286 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms