Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Usf1Q61069 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usf1Q61069 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usf1Q61069 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usf1Q61069 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usf1Q61069 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usf1Q61069 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usf1Q61069 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usf1Q61069 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usf1Q61069 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usf1Q61069 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usf1Q61069 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usf1Q61069 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usf1Q61069 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usf1Q61069 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usf1Q61069 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usf1Q61069 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usf1Q61069 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usf1Q61069 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usf1Q61069 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usf1Q61069 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usf1Q61069 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usf1Q61069 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usf1Q61069 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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