Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Foxg1Q60987 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Foxg1Q60987 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms