Protein–RNA interactions for Protein: Q60961

Laptm4a, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Laptm4aQ60961 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Laptm4aQ60961 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Laptm4aQ60961 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms