Protein–RNA interactions for Protein: Q60954

Meis1, Homeobox protein Meis1, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis1Q60954 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Meis1Q60954 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Meis1Q60954 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms