Protein–RNA interactions for Protein: Q60952

Cep250, Centrosome-associated protein CEP250, mousemouse

Predictions only

Length 2,414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep250Q60952 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep250Q60952 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep250Q60952 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep250Q60952 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep250Q60952 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cep250Q60952 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep250Q60952 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep250Q60952 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep250Q60952 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep250Q60952 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep250Q60952 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep250Q60952 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep250Q60952 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep250Q60952 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep250Q60952 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep250Q60952 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Cep250Q60952 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep250Q60952 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep250Q60952 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep250Q60952 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep250Q60952 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep250Q60952 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep250Q60952 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Cep250Q60952 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep250Q60952 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cep250Q60952 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Cep250Q60952 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Cep250Q60952 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cep250Q60952 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cep250Q60952 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Cep250Q60952 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cep250Q60952 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Cep250Q60952 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep250Q60952 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep250Q60952 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep250Q60952 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep250Q60952 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cep250Q60952 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Cep250Q60952 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep250Q60952 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep250Q60952 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cep250Q60952 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Cep250Q60952 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cep250Q60952 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cep250Q60952 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cep250Q60952 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cep250Q60952 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cep250Q60952 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cep250Q60952 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cep250Q60952 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cep250Q60952 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cep250Q60952 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cep250Q60952 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cep250Q60952 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Cep250Q60952 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cep250Q60952 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cep250Q60952 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cep250Q60952 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cep250Q60952 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cep250Q60952 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cep250Q60952 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cep250Q60952 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cep250Q60952 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cep250Q60952 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cep250Q60952 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cep250Q60952 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cep250Q60952 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms