Protein–RNA interactions for Protein: Q60846

Tnfrsf8, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 8, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf8Q60846 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tnfrsf8Q60846 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tnfrsf8Q60846 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms