Protein–RNA interactions for Protein: Q60793

Klf4, Krueppel-like factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf4Q60793 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Klf4Q60793 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Klf4Q60793 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms