Protein–RNA interactions for Protein: Q60773

Cdkn2d, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor D, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2dQ60773 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cdkn2dQ60773 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cdkn2dQ60773 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms