Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cdkn2cQ60772 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdkn2cQ60772 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms