Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atf3Q60765 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atf3Q60765 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms