Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Csnk2a1Q60737 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Csnk2a1Q60737 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms