Protein–RNA interactions for Protein: Q60722

Tcf4, Transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf4Q60722 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Tcf4Q60722 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcf4Q60722 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcf4Q60722 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcf4Q60722 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcf4Q60722 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcf4Q60722 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcf4Q60722 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcf4Q60722 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcf4Q60722 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcf4Q60722 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcf4Q60722 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tcf4Q60722 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf4Q60722 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf4Q60722 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf4Q60722 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf4Q60722 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf4Q60722 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf4Q60722 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf4Q60722 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf4Q60722 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf4Q60722 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf4Q60722 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf4Q60722 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf4Q60722 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf4Q60722 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf4Q60722 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf4Q60722 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf4Q60722 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf4Q60722 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tcf4Q60722 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcf4Q60722 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcf4Q60722 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcf4Q60722 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcf4Q60722 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcf4Q60722 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcf4Q60722 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcf4Q60722 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcf4Q60722 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tcf4Q60722 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms