Protein–RNA interactions for Protein: Q60674

Nr1d2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d2Q60674 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr1d2Q60674 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms