Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprnQ60673 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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PtprnQ60673 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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PtprnQ60673 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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PtprnQ60673 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PtprnQ60673 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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