Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nr2f1Q60632 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nr2f1Q60632 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms