Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sin3aQ60520 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sin3aQ60520 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms