Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc5a6Q5U4D8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc5a6Q5U4D8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms