Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Med13Q5SWW4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med13Q5SWW4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Med13Q5SWW4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med13Q5SWW4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med13Q5SWW4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med13Q5SWW4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Med13Q5SWW4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med13Q5SWW4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Med13Q5SWW4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med13Q5SWW4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med13Q5SWW4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med13Q5SWW4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med13Q5SWW4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med13Q5SWW4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Med13Q5SWW4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med13Q5SWW4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Med13Q5SWW4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med13Q5SWW4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Med13Q5SWW4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med13Q5SWW4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med13Q5SWW4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med13Q5SWW4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med13Q5SWW4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med13Q5SWW4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Med13Q5SWW4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Med13Q5SWW4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med13Q5SWW4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med13Q5SWW4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med13Q5SWW4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med13Q5SWW4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med13Q5SWW4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med13Q5SWW4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med13Q5SWW4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med13Q5SWW4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Med13Q5SWW4 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med13Q5SWW4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med13Q5SWW4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med13Q5SWW4 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med13Q5SWW4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med13Q5SWW4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med13Q5SWW4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med13Q5SWW4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med13Q5SWW4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med13Q5SWW4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med13Q5SWW4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med13Q5SWW4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med13Q5SWW4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Med13Q5SWW4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med13Q5SWW4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Med13Q5SWW4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Med13Q5SWW4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Med13Q5SWW4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms