Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Bbs12Q5SUD9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Bbs12Q5SUD9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms