Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUC9

Sco1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sco1Q5SUC9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sco1Q5SUC9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sco1Q5SUC9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms