Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sft2d1Q5SSN7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Sft2d1Q5SSN7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms