Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Utp18Q5SSI6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Utp18Q5SSI6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms