Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Rnf215Q5SPX3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf215Q5SPX3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms