Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdv2-2Q5R1A4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdv2-2Q5R1A4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdv2-2Q5R1A4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trdv2-2Q5R1A4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trdv2-2Q5R1A4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms