Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rtp3Q5QGU6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms