Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ttf2Q5NC05 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ttf2Q5NC05 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms