Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vps41Q5KU39 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vps41Q5KU39 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms