Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ndufaf2Q59J78 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndufaf2Q59J78 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndufaf2Q59J78 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndufaf2Q59J78 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndufaf2Q59J78 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndufaf2Q59J78 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndufaf2Q59J78 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndufaf2Q59J78 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndufaf2Q59J78 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndufaf2Q59J78 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ndufaf2Q59J78 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufaf2Q59J78 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufaf2Q59J78 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufaf2Q59J78 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufaf2Q59J78 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufaf2Q59J78 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufaf2Q59J78 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufaf2Q59J78 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufaf2Q59J78 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufaf2Q59J78 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufaf2Q59J78 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufaf2Q59J78 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufaf2Q59J78 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufaf2Q59J78 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufaf2Q59J78 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ndufaf2Q59J78 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms