Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
E2f8Q58FA4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2f8Q58FA4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2f8Q58FA4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2f8Q58FA4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2f8Q58FA4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2f8Q58FA4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2f8Q58FA4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2f8Q58FA4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2f8Q58FA4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2f8Q58FA4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2f8Q58FA4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2f8Q58FA4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2f8Q58FA4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2f8Q58FA4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2f8Q58FA4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2f8Q58FA4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
E2f8Q58FA4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2f8Q58FA4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2f8Q58FA4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2f8Q58FA4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2f8Q58FA4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2f8Q58FA4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2f8Q58FA4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2f8Q58FA4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2f8Q58FA4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2f8Q58FA4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2f8Q58FA4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2f8Q58FA4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2f8Q58FA4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2f8Q58FA4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2f8Q58FA4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2f8Q58FA4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2f8Q58FA4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2f8Q58FA4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2f8Q58FA4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
E2f8Q58FA4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
E2f8Q58FA4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2f8Q58FA4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2f8Q58FA4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2f8Q58FA4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2f8Q58FA4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2f8Q58FA4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2f8Q58FA4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2f8Q58FA4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2f8Q58FA4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2f8Q58FA4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2f8Q58FA4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2f8Q58FA4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
E2f8Q58FA4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
E2f8Q58FA4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
E2f8Q58FA4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
E2f8Q58FA4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2f8Q58FA4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2f8Q58FA4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2f8Q58FA4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2f8Q58FA4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2f8Q58FA4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2f8Q58FA4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2f8Q58FA4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2f8Q58FA4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2f8Q58FA4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2f8Q58FA4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2f8Q58FA4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
E2f8Q58FA4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
E2f8Q58FA4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2f8Q58FA4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2f8Q58FA4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2f8Q58FA4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2f8Q58FA4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
E2f8Q58FA4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2f8Q58FA4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2f8Q58FA4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2f8Q58FA4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2f8Q58FA4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2f8Q58FA4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2f8Q58FA4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
E2f8Q58FA4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2f8Q58FA4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2f8Q58FA4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2f8Q58FA4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
E2f8Q58FA4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2f8Q58FA4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2f8Q58FA4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
E2f8Q58FA4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2f8Q58FA4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2f8Q58FA4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2f8Q58FA4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2f8Q58FA4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2f8Q58FA4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2f8Q58FA4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2f8Q58FA4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2f8Q58FA4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2f8Q58FA4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2f8Q58FA4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2f8Q58FA4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2f8Q58FA4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2f8Q58FA4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
E2f8Q58FA4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
E2f8Q58FA4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms