Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Otol1Q4ZJM7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Otol1Q4ZJM7 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms