Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Shank3Q4ACU6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Shank3Q4ACU6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms