Protein–RNA interactions for Protein: Q499M4

Tigd5, Tigger transposable element derived 5, mousemouse

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tigd5Q499M4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tigd5Q499M4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tigd5Q499M4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tigd5Q499M4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tigd5Q499M4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tigd5Q499M4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tigd5Q499M4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tigd5Q499M4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tigd5Q499M4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tigd5Q499M4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tigd5Q499M4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tigd5Q499M4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tigd5Q499M4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tigd5Q499M4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tigd5Q499M4 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tigd5Q499M4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tigd5Q499M4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tigd5Q499M4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tigd5Q499M4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Tigd5Q499M4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tigd5Q499M4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tigd5Q499M4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tigd5Q499M4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tigd5Q499M4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tigd5Q499M4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tigd5Q499M4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tigd5Q499M4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tigd5Q499M4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tigd5Q499M4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tigd5Q499M4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms