Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2J1

6430531B16Rik, RIKEN cDNA 6430531B16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430531B16RikQ3V2J1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
6430531B16RikQ3V2J1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
6430531B16RikQ3V2J1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
6430531B16RikQ3V2J1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms