Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ulk4Q3V129 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ulk4Q3V129 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms